| UGT1A7 SNPs table | ||||||||||||
| Access UGT1A7 haplotypes table | ||||||||||||
| Reference sequence for the annotation: NT_005120.15 (dbSNP reference sequence) | ||||||||||||
| Rs | Observed | mRNA1 | Protein2 | DNAg3 | Nucleotide position1,4 | Comment | ||||||
| 28969708 | A/G | g.518355A>G | -4983 | |||||||||
| 28970012 | A/G | g.518463G>A | -4875 | |||||||||
| 28970013 | G/T | g.518503G>T | -4835 | |||||||||
| 28970014 | A/G | g.518534G>A | -4804 | |||||||||
| 28970015 | G/T | g.518790G>T | -4548 | |||||||||
| 28970016 | C/T | g.518993T>C | -4345 | |||||||||
| 28948388 | A/T | g.519272A>T | -4066 | |||||||||
| 7571915 | A/G | g.519328G>A | -4010 | |||||||||
| 4663877 | A/G | g.519425G>A | -3913 | |||||||||
| 7587916 | A/G | g.519568A>G | -3770 | |||||||||
| 7588138 | A/T | g.519728A>T | -3610 | |||||||||
| 7582907 | C/G | g.519735C>G | -3603 | |||||||||
| 12477979 | A/T | g.519737T>A | -3601 | |||||||||
| 11692664 | A/G | g.519962A>G | -3376 | |||||||||
| 10190976 | G/T | g.520196G>T | -3142 | |||||||||
| 12053462 | A/G | g.520393A>G | -2945 | |||||||||
| 10202865 | C/T | g.520461C>T | -2877 | |||||||||
| 35984508 | A/G | g.520606G>A | -2732 | |||||||||
| 7595138 | C/T | g.520799T>C | -2539 | |||||||||
| 7579530 | A/G | g.521339G>A | -1999 | |||||||||
| 28948389 | G/T | g.521455T>G | -1883 | |||||||||
| 17874939 | G/T | g.521499T>G | -1839 | |||||||||
| 28970017 | A/C | g.521664A>C | -1674 | |||||||||
| 28970018 | A/G | g.521795G>A | -1543 | |||||||||
| 17863777 | G/T | g.521851G>T | -1487 | |||||||||
| 28969709 | C/T | g.521859C>T | -1479 | |||||||||
| 10197460 | G/T | g.521944G>T | -1394 | |||||||||
| 10167119 | C/T | g.522066T>C | -1272 | |||||||||
| 28969710 | A/T | g.522234A>T | -1104 | |||||||||
| 10199293 | C/T | g.522258T>C | -1080 | |||||||||
| 12474215 | A/T | g.522314A>T | -1024 | |||||||||
| 12472689 | C/T | g.522370C>T | -968 | |||||||||
| 28969711 | A/G | g.522504G>A | -834 | |||||||||
| 45574033 | C/T | g.522586C>T | -752 | |||||||||
| 4530361 | A/G | g.522795A>G | -543 | |||||||||
| 45497792 | A/G | g.522867G>A | -471 | |||||||||
| 28946877 | C/T | g.522997C>T | -341 | |||||||||
| 67836009 | -/A | g.523004delA | -334 | |||||||||
| 28969712 | G/T | g.523232T>G | -106 | |||||||||
| A/G | g.523268G>A | -70 | ||||||||||
| 7586110 | G/T | g.523281T>G | -57 | |||||||||
| 7577677 | A/C | c.33C>A | p.Pro11Pro | g.523370C>A | 33 | |||||||
| 7577789 | C/G | c.168C>G | p.Val56Val | g.523505C>G | 168 | |||||||
| 72551331 | A/G | c.267G>A | p.Glu89Glu | g.523604G>A | 267 | |||||||
| 45437497 | A/G | c.274G>A | p.Val92Ile | g.523611G>A | 274 | |||||||
| 61261057 | A/G | c.343G>A | p.Gly115Ser | g.523680G>A | 343 | |||||||
| 56385016 | A/G | c.386A>G | p.Asn129Ser | g.523723A>G | 386 | |||||||
| 17868323 | G/T | c.387T>G | p.Asn129Lys | g.523724T>G | 387 | |||||||
| 17863778 | A/C | c.391C>A | p.Arg131Arg | g.523728C>A | 391 | |||||||
| 17868324 | A/G | c.392G>A | p.Arg131Gln | g.523729G>A | 392 | |||||||
| C/G | c.417G>C | p.Glu139Asp | g.523754G>C | 417 | ||||||||
| 72551332 | C/G | c.422G>C | p.Cys141Ser | g.523759G>C | 422 | |||||||
| 28946878 | A/T | c.531T>A | p.Leu177Leu | g.523868T>A | 531 | |||||||
| 11692021 | C/T | c.622T>C | p.Try208Arg | g.523959T>C | 622 | |||||||
| 45462096 | C/T | c.660C>T | P.Cys220Cys | g.523997C>T | 660 | |||||||
| 28969713 | A/T | c.694T>A | p.Ser232Thr | g.524031T>A | 694 | |||||||
| 17864686 | A/G | c.756G>A | p.Leu252Leu | g.524093G>A | 756 | |||||||
| 71423608 | G/T | c.757T>G | p.Leu253Val | g.524094T>G | 757 | |||||||
| C/T | c.760C>T | p.Arg254X | g.524097C>T | 760 | ||||||||
| C/A | c.828C>A | p.Asn276Lys | g.524165C>A | 828 | ||||||||
| 28969714 | A/T | g.524216A>T | IVS1+24 | |||||||||
| 71423609 | A/C | g.524462A>C | IVS1+270 | |||||||||
| 45437594 | C/T | g.524600T>C | IVS1+408 | |||||||||
| 4663888 | A/G | g.524741G>A | IVS1+549 | |||||||||
| 45589132 | A/G | g.525009G>A | IVS1+817 | |||||||||
| 45549736 | G/T | g.525072T>G | IVS1+880 | |||||||||
| 45486299 | C/G | g.525076C>G | IVS1+884 | |||||||||
| 17864687 | C/T | g.525221C>T | IVS1+1029 | |||||||||
| 28898568 | C/T | g.525388C>T | IVS1+1196 | |||||||||
| 4433994 | G/T | g.525389G>T | IVS1+1197 | |||||||||
| 28898569 | C/T | g.525425T>C | IVS1+1233 | |||||||||
| 45511895 | C/G | g.525437C>G | IVS1+1245 | |||||||||
| 45618247 | A/G | g.525569G>A | IVS1+1377 | |||||||||
| 6724485 | A/G | g.525570G>A | IVS1+1378 | |||||||||
| 28898570 | C/G | g.525633C>G | IVS1+1441 | |||||||||
| 45566031 | A/G | g.525675A>G | IVS1+1483 | |||||||||
| 4347832 | C/T | g.525795T>C | IVS1+1603 | |||||||||
| 4261716 | G/T | g.525871G>T | IVS1+1679 | |||||||||
| 4583459 | G/T | g.526128G>T | IVS1+1936 | |||||||||
| 45548336 | A/G | g.526136A>G | IVS1+1944 | |||||||||
| 13002774 | A/G | g.526460G>A | IVS1+2268 | |||||||||
| 45498701 | C/T | g.526621C>T | IVS1+2429 | |||||||||
| 4338954 | C/G | g.526685C>G | IVS1+2493 | |||||||||
| 28898571 | A/G | g.526809A>G | IVS1+2617 | |||||||||
| 4553819 | A/G | g.526837A>G | IVS1+2645 | |||||||||
| 28898572 | A/C | g.526978C>A | IVS1+2786 | |||||||||
| 17864689 | G/T | g.526988G>T | IVS1+2796 | |||||||||
| 11902131 | C/T | g.527023C>T | IVS1+2831 | |||||||||
| 17868325 | G/T | g.527141T>G | IVS1+2949 | |||||||||
| 12989181 | A/C | g.527256A>C | IVS1+3064 | |||||||||
| 12989182 | A/C | g.527258A>C | IVS1+3066 | |||||||||
| 6753317 | A/T | g.527733T>A | IVS1+3541 | |||||||||
| 6753320 | A/C | g.528369A>C | IVS1+4177 | |||||||||
| 6736508 | A/G | g.528501G>A | IVS1+4309 | |||||||||
| 6753569 | A/C | g.528571A>C | IVS1+4379 | |||||||||
| 6736743 | A/G | g.528704G>A | IVS1+4512 | |||||||||
| 6737107 | A/G | g.528949G>A | IVS1+4757 | |||||||||
| 6754100 | A/C | g.528968A>C | IVS1+4776 | |||||||||
| 10203266 | C/G | g.529122G>C | IVS1+4930 | |||||||||
| 28899168 | A/G | g.529175A>G | IVS1+4983 | |||||||||
| 17863781 | C/G | g.529269C>G | IVS1+5077 | |||||||||
| 1Coding positions are relative to the adenine (+1) of the ATG | ||||||||||||
| 2Amino acid positions are relative to the first amino acid (+1) | ||||||||||||
| 3Genomic positions are relative to the start of the reference contig NT_005120.15 | ||||||||||||
| 4Promoter positions are relative to adenine (+1) of the ATG; Intronic positions are relative to the end of the previous exon (+1 being the first non-coding nucleotide at the end of each exon) | ||||||||||||