| UGT1A3 SNPs table | ||||||||||||
| Access UGT1A3 haplotypes table | ||||||||||||
| Reference sequence for the annotation: NT_005120.15 (dbSNP reference sequence) | ||||||||||||
| Rs | Observed | mRNA1 | Protein2 | DNAg3 | Nucleotide position1,4 | Comment | ||||||
| 4286271 | C/T | g.565920T>C | -4607 | |||||||||
| 4341922 | C/T | g.566099C>T | -4428 | |||||||||
| 62191902 | C/G | g.566213C>G | -4314 | |||||||||
| 73108990 | A/G | g.566406G>A | -4121 | |||||||||
| 71963537 | -/GAGGCAGAG | g.566656_566657ins9 | -3871 | |||||||||
| 72086450 | -/CAG | g.566666_566667ins3 | -3861 | |||||||||
| 57292167 | -/CAG | g.566681_566683del3 | -3846 | |||||||||
| 57417437 | C/G | g.566693C>G | -3834 | |||||||||
| 59772713 | C/G | g.566699C>G | -3828 | |||||||||
| 59627078 | C/G | g.566705C>G | -3822 | |||||||||
| 57258852 | C/G | g.566711C>G | -3816 | |||||||||
| 61475847 | C/T | g.566717C>T | -3810 | |||||||||
| 28899189 | A/C | g.567078A>C | -3449 | |||||||||
| 28899190 | C/T | g.567381C>T | -3146 | |||||||||
| 28899191 | C/G | g.567393G>C | -3134 | |||||||||
| 6711351 | A/G | g.567670A>G | -2857 | |||||||||
| 6715325 | C/T | g.567995T>C | -2532 | |||||||||
| 17864697 | C/T | g.568121T>C | -2406 | |||||||||
| 56114701 | A/G | g.568221A>G | -2306 | |||||||||
| 17864698 | C/T | g.568633T>C | -1894 | |||||||||
| 17863793 | C/T | g.568980T>C | -1547 | |||||||||
| 13407590 | A/G | g.569257A>G | -1270 | |||||||||
| 45459598 | C/T | g.569675C>T | -852 | |||||||||
| 55772651 | A/G | g.569769A>G | -758 | |||||||||
| 1983023 | C/T | g.569776T>C | -751 | |||||||||
| 55998468 | C/T | g.569934A>G | -593 | |||||||||
| 56304713 | A/G | g.569946C>T | -581 | |||||||||
| 61764026 | C/T | g.569971T>C | -556 | |||||||||
| 45507691 | A/G | g.569974G>A | -553 | |||||||||
| 28898616 | C/T | g.569980C>T | -547 | |||||||||
| 61764028 | A/T | g.570299T>A | -228 | |||||||||
| 45496293 | C/G | g.570320G>C | -207 | |||||||||
| 3806597 | C/T | g.570323A>G | -204 | |||||||||
| 55781538 | C/T | g.570379T>C | -148 | |||||||||
| 3806596 | A/G | g.570461T>C | -66 | |||||||||
| 28898617 | A/G | c.17A>G | p.Gln6Arg | g.570543A>G | 17 | |||||||
| 3821242 | A/G | c.31T>C | p.Try11Arg | g.570557T>C | 31 | |||||||
| 6706232 | A/G | c.81G>A | p.Glu27Glu | g.570607G>A | 81 | |||||||
| 45625338 | C/T | c.133C>T | p.Arg45Try | g.570659C>T | 133 | |||||||
| 6431625 | C/T | c.140T>C | p.Val47Ala | g.570666T>C | 140 | |||||||
| 45595237 | C/T | c.145C>T | p.Arg49Try | g.570671C>T | 145 | |||||||
| 28898618 | C/T | c.233C>T | p.Thr78Ile | g.570759C>T | 233 | |||||||
| 17868336 | A/G | c.234A>G | p.Thr78Thr | g.570760A>G | 234 | |||||||
| A/T | c.328T>A | p.Phe110Ile | g.570854T>A | 328 | ||||||||
| 28898619 | A/G | c.342G>A | p.Met114Ile | g.570868G>A | 342 | |||||||
| 13406898 | C/T | c.431C>T | p.Thr144Ile | g.570957C>T | 431 | |||||||
| 61764029 | -/C | c.435insC | g.570961_570962insC | 435 | ||||||||
| 61764030 | C/T | c.473C>T | p.Ala158Val | g.570999C>T | 473 | |||||||
| 7574296 | A/G | c.477A>G | p.Ala159Ala | g.571003A>G | 477 | |||||||
| 45586035 | -/T | c.518insT | g.571044_571045insT | 518 | ||||||||
| 61764031 | A/T | c.523A>T | p.Asn175Tyr | g.571049A>T | 523 | |||||||
| 72551338 | -/C | c.529delC | p.Pro177fx | g.571055delC | 529 | |||||||
| C/T | c.537T>C | p.Asp179Asp | g.571063T>C | 537 | ||||||||
| 45474199 | C/T | c.567C>T | p.Asn189Ans | g.571093C>T | 567 | |||||||
| A/C | c.622A>C | p.Met208Leu | g.571148A>C | 622 | ||||||||
| 45547931 | A/G | c.676G>A | p.Ala226Thr | g.571202G>A | 676 | |||||||
| 61740163 | G/T | c.679T>G | p.Phe227Val | g.571205T>G | 679 | |||||||
| 28898620 | C/T | c.782T>C | p.Phe261Ser | g.571308T>C | 782 | |||||||
| 45449995 | A/G | c.808A>G | p.Met270Val | g.571334A>G | 808 | |||||||
| 45599733 | A/T | g.571435A>T | IVS1+42 | |||||||||
| 45486905 | A/T | g.571572A>T | IVS1+179 | |||||||||
| 45449797 | A/G | g.571663G>A | IVS1+270 | |||||||||
| 45560734 | A/G | g.571922G>A | IVS1+529 | |||||||||
| 28898621 | C/T | g.571965C>T | IVS1+572 | |||||||||
| 11891311 | A/G | g.572064G>A | IVS1+671 | |||||||||
| 45468195 | C/T | g.572129C>T | IVS1+736 | |||||||||
| 45510999 | G/T | g.572197T>G | IVS1+804 | |||||||||
| 34956169 | -/G | g.572284_572285insG | IVS1+891 | |||||||||
| 17868337 | A/G | g.572410G>A | IVS1+1017 | |||||||||
| 28898622 | A/G | g.572725G>A | IVS1+1332 | |||||||||
| 17862872 | A/C | g.572834C>A | IVS1+1441 | |||||||||
| 73110805 | A/C | g.572847C>A | IVS1+1454 | |||||||||
| 62191916 | G/T | g.573056T>G | IVS1+1663 | |||||||||
| 60103279 | A/G | g.573878A>G | IVS1+2485 | |||||||||
| 28899192 | C/T | g.574119C>T | IVS1+2726 | |||||||||
| 35556536 | -/C | g.574143_574144insC | IVS1+2750 | |||||||||
| 34548624 | C/G | g.574358C>G | IVS1+2965 | |||||||||
| 11685892 | A/T | g.574662T>A | IVS1+3269 | |||||||||
| 13410335 | G/T | g.574769T>G | IVS1+3376 | |||||||||
| 9711095 | G/T | g.575533G>T | IVS1+4140 | |||||||||
| 7567468 | C/T | g.575592C>T | IVS1+4199 | |||||||||
| 7576166 | A/G | g.576314A>G | IVS1+4921 | |||||||||
| 71423611 | A/G | g.576399G>A | IVS1+5006 | |||||||||
| 4477910 | A/T | g.576491A>T | IVS1+5098 | |||||||||
| 4467260 | C/T | g.576503C>T | IVS1+5110 | |||||||||
| 2363116 | C/G | g.577175C>G | IVS1+5782 | |||||||||
| 61296714 | A/G | g.577199G>A | IVS1+5806 | |||||||||
| 28899193 | A/T | g.577468T>A | IVS1+6075 | |||||||||
| 7564935 | G/T | g.577940G>T | IVS1+6547 | |||||||||
| 11684169 | G/T | g.578521G>T | IVS1+7128 | |||||||||
| 28898623 | C/T | g.579100C>T | IVS1+7707 | |||||||||
| 28898624 | A/G | g.579101G>A | IVS1+7708 | |||||||||
| 28898625 | A/T | g.579138T>A | IVS1+7745 | |||||||||
| 11902620 | C/T | g.579391T>C | IVS1+7998 | |||||||||
| 11902624 | C/T | g.579418T>C | IVS1+8025 | |||||||||
| 28899194 | C/T | g.579436C>T | IVS1+8043 | |||||||||
| 17862873 | A/C | g.579476A>C | IVS1+8083 | |||||||||
| 56839564 | -/TCCC | g.579630_579631ins4 | IVS1+8237 | |||||||||
| 57963849 | A/C | g.579643A>C | IVS1+8250 | |||||||||
| 6722076 | A/G | g.580071G>A | IVS1+8678 | |||||||||
| 35967186 | -/C | g.580107_580108insC | IVS1+8714 | |||||||||
| 6431628 | A/G | g.580232A>G | IVS1+8839 | |||||||||
| 11691824 | C/G | g.580679C>G | IVS1+9286 | |||||||||
| 11691827 | C/T | g.580698C>T | IVS1+9305 | |||||||||
| 35203555 | -/C | g.580893_580894insC | IVS1+9500 | |||||||||
| 28899195 | A/C | g.581121A>C | IVS1+9728 | |||||||||
| 28899196 | A/G | g.581134G>A | IVS1+9741 | |||||||||
| 28899197 | C/T | g.581139C>T | IVS1+9746 | |||||||||
| 11695770 | C/T | g.581206T>C | IVS1+9813 | |||||||||
| 28899198 | G/T | g.581217T>G | IVS1+9824 | |||||||||
| 28900069 | G/T | g.581245T>G | IVS1+9852 | |||||||||
| 28900070 | A/G | g.581269A>G | IVS1+9876 | |||||||||
| 28900073 | C/T | g.581322C>T | IVS1+9929 | |||||||||
| 28900074 | A/T | g.581337T>A | IVS1+9944 | |||||||||
| 28900075 | C/G | g.581354C>G | IVS1+9961 | |||||||||
| 28900076 | A/G | g.581361A>G | IVS1+9968 | |||||||||
| 28900077 | A/T | g.581383A>T | IVS1+9990 | |||||||||
| 28899768 | C/T | g.581393T>C | IVS1+10000 | |||||||||
| 28899769 | A/C | g.581413C>A | IVS1+10020 | |||||||||
| 6740653 | A/C | g.581462C>A | IVS1+10069 | |||||||||
| 17862874 | A/G | g.581500A>G | IVS1+10107 | |||||||||
| 2018985 | A/G | g.581614A>G | IVS1+10221 | |||||||||
| 6746419 | A/G | g.581637A>G | IVS1+10244 | |||||||||
| 60932271 | C/T | g.581958C>T | IVS1+10565 | |||||||||
| 17862875 | A/G | g.582056G>A | IVS1+10663 | |||||||||
| 10714492 | -/T | g.582328delT | IVS1+10935 | |||||||||
| 17868338 | C/T | g.582419C>T | IVS1+11026 | |||||||||
| 28900368 | C/T | g.582562T>C | IVS1+11169 | |||||||||
| 28900369 | A/T | g.582632T>A | IVS1+11239 | |||||||||
| 28900370 | C/T | g.582873C>T | IVS1+11480 | |||||||||
| 4663963 | G/T | g.582947T>G | IVS1+11554 | |||||||||
| 28900371 | A/G | g.582962G>A | IVS1+11569 | |||||||||
| 4663964 | C/T | g.582990C>T | IVS1+11597 | |||||||||
| 28900372 | A/T | g.583103T>A | IVS1+11710 | |||||||||
| 34352510 | C/T | g.583316T>C | IVS1+11923 | |||||||||
| 4663965 | C/T | g.583358T>C | IVS1+11965 | |||||||||
| 4663966 | C/T | g.583718C>T | IVS1+12325 | |||||||||
| 62191917 | G/T | g.583825T>G | IVS1+12432 | |||||||||
| 73110819 | C/T | g.583842C>T | IVS1+12449 | |||||||||
| 28900373 | G/T | g.583977G>T | IVS1+12584 | |||||||||
| 17863795 | C/T | g.584123T>C | IVS1+12730 | |||||||||
| 28900374 | A/G | g.584296A>G | IVS1+12903 | |||||||||
| 1054809 | A/G | g.584413C>T | IVS1+13020 | |||||||||
| 1054805 | A/G | g.584417T>C | IVS1+13024 | |||||||||
| 1054803 | C/T | g.584455G>A | IVS1+13062 | |||||||||
| 17874976 | C/T | g.584467T>C | IVS1+13074 | |||||||||
| 1054801 | C/T | g.584468G>A | IVS1+13075 | |||||||||
| 1054800 | C/T | g.584476G>A | IVS1+13083 | |||||||||
| 3796088 | C/T | g.584554T>C | IVS1+13161 | |||||||||
| 28900375 | C/T | g.584576T>C | IVS1+13183 | |||||||||
| 17863796 | A/C | g.584634A>C | IVS1+13241 | |||||||||
| 35742148 | -/G | g.584816_584817insG | IVS1+13423 | |||||||||
| 34135810 | C/T | g.584939T>C | IVS1+13546 | |||||||||
| 28900376 | A/C | p.Phe112Leu | g.584981A>C | IVS1+13588 | DNAJB3 gene | |||||||
| 28900377 | C/T | g.585011C>T | IVS1+13618 | |||||||||
| 34150486 | C/G | p.Asp98Glu | g.585023G>C | IVS1+13630 | DNAJB3 gene | |||||||
| 34622615 | G/T | p.Asp85Glu | g.585062G>T | IVS1+13669 | DNAJB3 gene | |||||||
| 13009407 | C/G | g.585101C>G | IVS1+13708 | |||||||||
| 62191918 | C/T | g.585236C>T | IVS1+13843 | |||||||||
| 6735370 | C/T | g.585382C>T | IVS1+13989 | |||||||||
| 60469444 | A/T | g.585394T>A | IVS1+14001 | |||||||||
| 17864701 | C/T | g.585471C>T | IVS1+14078 | |||||||||
| 17864702 | C/T | g.585793C>T | IVS1+14400 | |||||||||
| 6741543 | A/T | g.585861A>T | IVS1+14468 | |||||||||
| 71905642 | -/TTA | g.585924_585926del3 | IVS1+14531 | |||||||||
| 4663967 | A/C | g.585938A>C | IVS1+14545 | |||||||||
| 6741669 | A/G | g.585946A>G | IVS1+14553 | |||||||||
| 28899468 | C/T | g.586046T>C | IVS1+14653 | |||||||||
| 17864703 | C/T | g.586252T>C | IVS1+14859 | |||||||||
| 28900378 | C/T | g.586292C>T | IVS1+14899 | |||||||||
| 56259169 | G/T | g.586305T>G | IVS1+14912 | |||||||||
| 13426130 | C/T | g.586692C>T | IVS1+15299 | |||||||||
| 28900379 | C/T | g.587076C>T | IVS1+15683 | |||||||||
| 11695484 | A/G | g.587203A>G | IVS1+15810 | |||||||||
| 4663968 | C/T | g.587898T>C | IVS1+16505 | |||||||||
| 4663333 | G/T | g.588057G>T | IVS1+16664 | |||||||||
| 4663969 | A/C | g.588067C>A | IVS1+16674 | |||||||||
| 35269037 | -/C | g.588366_588367insC | IVS1+16973 | |||||||||
| 28946888 | C/G | g.588530G>C | IVS1+17137 | |||||||||
| 35672427 | -/G | g.588536_588537insG | IVS1+17143 | |||||||||
| 28900380 | A/G | g.588786G>A | IVS1+17393 | |||||||||
| 36069080 | -/C | g.588884_588885insC | IVS1+17491 | |||||||||
| 28900381 | A/T | g.588969T>A | IVS1+17576 | |||||||||
| 4595965 | C/T | g.589040C>T | IVS1+17647 | |||||||||
| 28900382 | C/G | g.589254G>C | IVS1+17861 | |||||||||
| 12466997 | C/T | g.589271T>C | IVS1+17878 | |||||||||
| 11888459 | C/T | g.589394T>C | IVS1+18001 | |||||||||
| 17863798 | C/T | g.589489C>T | IVS1+18096 | |||||||||
| 59292838 | A/G | g.589866A>G | IVS1+18473 | |||||||||
| 58741345 | A/G | g.589887A>G | IVS1+18494 | |||||||||
| 60390282 | C/T | g.589916C>T | IVS1+18523 | |||||||||
| 28900383 | A/T | g.590195A>T | IVS1+18802 | |||||||||
| 17862876 | G/T | g.590266G>T | IVS1+18873 | |||||||||
| 10178992 | A/T | g.590631T>A | IVS1+19238 | |||||||||
| 28900384 | C/G | g.590691C>G | IVS1+19298 | |||||||||
| 10179091 | C/T | g.590737T>C | IVS1+19344 | |||||||||
| 7604115 | C/T | g.590870C>T | IVS1+19477 | |||||||||
| 7556676 | A/G | g.591004A>G | IVS1+19611 | |||||||||
| 7556792 | A/C | g.591102A>C | IVS1+19709 | |||||||||
| 2221198 | C/T | g.591377G>A | IVS1+19984 | |||||||||
| 12987866 | A/G | g.591466G>A | IVS1+20073 | |||||||||
| 2885296 | A/C | g.591815A>C | IVS1+20422 | |||||||||
| 62191919 | G/T | g.592225G>T | IVS1+20832 | |||||||||
| 28899469 | C/G | g.592256G>C | IVS1+20863 | |||||||||
| 28899470 | C/T | g.592387C>T | IVS1+20994 | |||||||||
| 28900071 | C/G | g.592934C>G | IVS1+21541 | |||||||||
| 55891750 | C/T | g.593240C>T | IVS1+21847 | |||||||||
| 28900385 | C/T | g.593890T>C | IVS1+22497 | |||||||||
| 17862878 | A/G | g.594702G>A | IVS1+23309 | |||||||||
| 28900386 | A/T | g.594869A>T | IVS1+23476 | |||||||||
| 28900387 | C/T | g.594927T>C | IVS1+23534 | |||||||||
| 7608038 | C/T | g.595017T>C | IVS1+23624 | |||||||||
| 28900388 | C/T | g.595062T>C | IVS1+23669 | |||||||||
| 60112223 | A/G | g.595359A>G | IVS1+23966 | |||||||||
| 28900389 | A/G | g.595558G>A | IVS1+24165 | |||||||||
| 28900390 | G/T | g.595661G>T | IVS1+24268 | |||||||||
| 17862879 | C/T | g.595740T>C | IVS1+24347 | |||||||||
| 1054804 | A/G | g.595799C>T | IVS1+24406 | |||||||||
| 3195319 | C/T | g.595809A>G | IVS1+24416 | |||||||||
| 3180324 | A/G | g.595821C>T | IVS1+24428 | |||||||||
| 1133497 | A/C | g.595925G>T | IVS1+24532 | |||||||||
| 1054790 | C/T | g.595978G>A | IVS1+24585 | |||||||||
| 10929301 | C/G | g.596403C>G | IVS1+25010 | |||||||||
| 28900391 | C/T | g.596476T>C | IVS1+25083 | |||||||||
| 62191920 | C/G | g.596496G>C | IVS1+25103 | |||||||||
| 41264157 | A/G | g.596511G>A | IVS1+25118 | |||||||||
| 1Coding positions are relative to the adenine (+1) of the ATG | ||||||||||||
| 2Amino acid positions are relative to the first amino acid (+1) | ||||||||||||
| 3Genomic positions are relative to the start of the reference contig NT_005120.15 | ||||||||||||
| 4Promoter positions are relative to adenine (+1) of the ATG; Intronic positions are relative to the end of the previous exon (+1 being the first non-coding nucleotide at the end of each exon) | ||||||||||||